Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSFMP43897 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSFMP43897 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TSFMP43897 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms