Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CRATP43155 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CRATP43155 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CRATP43155 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms