Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIA2P42262 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GRIA2P42262 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms