Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TRIM23P36406 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TRIM23P36406 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms