Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXD12P35452 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXD12P35452 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms