Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RYKP34925 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RYKP34925 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RYKP34925 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYKP34925 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYKP34925 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYKP34925 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYKP34925 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYKP34925 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYKP34925 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYKP34925 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYKP34925 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYKP34925 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYKP34925 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYKP34925 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYKP34925 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RYKP34925 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms