Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF4P34130 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF4P34130 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF4P34130 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF4P34130 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF4P34130 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF4P34130 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF4P34130 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF4P34130 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NTF4P34130 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NTF4P34130 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NTF4P34130 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NTF4P34130 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms