Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXC12P31275 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms