Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GJB2P29033 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GJB2P29033 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJB2P29033 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJB2P29033 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms