Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSFA2P28290 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms