Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
DNMT1P26358 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DNMT1P26358 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms