Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTNNA2P26232 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms