Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRDP23468 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRDP23468 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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