Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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