Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFRSF1BP20333 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms