Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB4P17483 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
HOXB4P17483 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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