Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB9P17482 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms