Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GTF2F2P13984 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GTF2F2P13984 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GTF2F2P13984 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms