Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GLI3P10071 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI3P10071 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI3P10071 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI3P10071 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI3P10071 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI3P10071 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI3P10071 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI3P10071 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GLI3P10071 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GLI3P10071 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GLI3P10071 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GLI3P10071 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GLI3P10071 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms