Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C8orf89P0DMQ9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms