Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RGPD1P0DJD0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD1P0DJD0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms