Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2BP0DI82 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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