Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC2P0DI81 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms