Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C4BP0C0L5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4BP0C0L5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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