Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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PKHD1P08F94 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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PKHD1P08F94 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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PKHD1P08F94 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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PKHD1P08F94 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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