Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRCP08575 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRCP08575 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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