Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ITGAVP06756 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGAVP06756 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms