Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-9P01782 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms