Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TOMM40O96008 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TOMM40O96008 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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