Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CBX7O95931 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CBX7O95931 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CBX7O95931 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CBX7O95931 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CBX7O95931 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CBX7O95931 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms