Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMUO75648 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMUO75648 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMUO75648 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TRMUO75648 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms