Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIN3BO75182 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIN3BO75182 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms