Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC9O60706 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC9O60706 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC9O60706 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC33.77■■■■□ 3
ABCC9O60706 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC9O60706 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC9O60706 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC33.77■■■■□ 3
ABCC9O60706 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC9O60706 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC9O60706 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC33.77■■■■□ 3
ABCC9O60706 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC9O60706 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ABCC9O60706 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ABCC9O60706 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms