Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PDE6DO43924 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDE6DO43924 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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