Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SCO2O43819 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SCO2O43819 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SCO2O43819 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms