Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KDM6AO15550 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms