Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYNMO15061 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYNMO15061 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYNMO15061 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNMO15061 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNMO15061 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYNMO15061 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYNMO15061 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYNMO15061 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms