Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLGNO14967 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLGNO14967 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms