Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APAF1O14727 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APAF1O14727 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APAF1O14727 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APAF1O14727 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APAF1O14727 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms