Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TXNDC9O14530 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms