Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TTLL13PA6NNM8 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms