Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

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Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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NPIPB13A6NJU9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NPIPB13A6NJU9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NPIPB13A6NJU9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NPIPB13A6NJU9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NPIPB13A6NJU9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NPIPB13A6NJU9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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NPIPB13A6NJU9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPIPB13A6NJU9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPIPB13A6NJU9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPIPB13A6NJU9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPIPB13A6NJU9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPIPB13A6NJU9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPIPB13A6NJU9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPIPB13A6NJU9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPIPB13A6NJU9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPIPB13A6NJU9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPIPB13A6NJU9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPIPB13A6NJU9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPIPB13A6NJU9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPIPB13A6NJU9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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