Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AUP1Q9Y679 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms