Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms