Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX8Q9Y5X2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms