Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
THRAP3Q9Y2W1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
THRAP3Q9Y2W1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms