Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ICE1Q9Y2F5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms