Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POMPQ9Y244 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms