Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254.4 ms