Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms